Cotele apelor Dunării se măsoară fata de un nivel de referința specific fiecărei localități. Este simplu de imaginat ca adâncimile nu pot fi luate ca referință. Adâncimile difera foarte mult chiar pentru o suprafața restrânsa.
Nivelul Dunării se măsoară fata de un nivel de referință iar nivelul de referință pentru o anumita localitate îl aveți în tabelul de mai jos exprimat în centimetri fata de nivelul Marii Negre. Daca vreți sa aflați nivelul Dunării fata de nivelul Marii Negre pentru o anumita localitate, adunați cota din ziua respectiva(exprimata în centimetri) cu valoarea cotei de referința pentru localitatea respectiva.
De exemplu, pentru Tulcea, cota de referință este de 56 de centimetri. O cota de 200 cm la Tulcea înseamna ca Dunărea are nivelul de 200 + 56 cm fata de nivelul Marii Negre.
Tabel cu valorile cotelor de referinta pentru cateva porturi Romanesti, de pe Dunare.
| Km | Localitate | Cota zero[cm] |
| 430 | Oltenita | 100 |
| 370,5 | Calarasi | 731 |
| 300 | Cernavoda | 487 |
| 253 | Harşova | 308 |
| 170 | Brăila | 108 |
| 150 | Galaţi | 86 |
| 103,8 | Isaccea | 69 |
| 71,3 | Tulcea | 56 |
| 39,44 | Gorgova | 31 |
| 23,15 | Crişan | 19 |
| 0 | Sulina | 0 |